本发明公开了一种分水器和一种燃料电池，该分水器包括首部分水段和尾部分水段，其中：首部分水段包括首部主流管和首部引流管，首部引流管能够将首部主流管内分离出的气体进行逆向引流并输出；尾部分水段包括尾部主流管和尾部引流管，尾部引流管能够将尾部主流管内分离出的气体进行逆向引流并输出。该分水器利用惯性力将气液混合物中的液滴与气体进行分离，能够保证良好地分水效率，并解决现有技术中的装置体积大和流阻大等技术问题。进一步地，该分水器还可以设置成多级柔性结构，以提升分水器的适用性。