本发明公开了一种孤子数量可调锁模光纤激光器，包括泵浦源以及由波分复用器、掺铒光纤、隔离器、可饱和吸收体、偏振控制器、偏振路径辅助模块和光纤耦合器依次首尾相连的光纤谐振腔。其中偏振路径辅助模块由偏振分束器、光纤耦合器和偏振合束器依次连接而成。装置引入偏振路径辅助模块，使从两个正交偏振轴产生的孤子在每次往返过程中都沿着不同的路径传播，极大地减弱了孤子之间的相互作用。本发明装置可以通过调节泵浦能量以偏振控制器来实现稳定的孤子束输出，孤子束中的孤子数量可以灵活地从1调整为6。输出的孤子束可以作为光通信中的数据载体，从而提高数据传输的比特率。