本发明涉及一种生物酶领域，尤其涉及一种生物酶原料处理装置。要解决的技术问题：提供一种生物酶原料处理装置。技术方案：一种生物酶原料处理装置，包括有支撑底板、侧框架板、操作控制屏、顶框板、传动分离机构、银耳脱离机构、分选机构和培养袋储存舱；支撑底板与侧框架板进行焊接。本发明达到了通过机器代替人工对养殖袋和养殖银耳进行批量分离处理，极大地提升了养殖银耳的生产效率，同时将养殖袋完整保留可进行二次使用，同时将大于限定直径范围的养殖银耳分离单独处理，具有更高的经济价值的效果。