本发明属于火工品制备领域，具体涉及一种基于主动式微混合器的炸药连续制备系统及方法。包括依次连接的流体驱动单元，重结晶单元和样品处理单元；流体驱动单元用于分别将溶剂和非溶剂驱动输送到重结晶单元；重结晶单元通过主动式微混合器生成炸药悬浮液；样品处理单元包括喷雾干燥装置和样品收集装置，喷雾干燥装置与主动式微混合器的出口直接连接，喷雾干燥装置将重结晶单元生成的炸药悬浮液生成炸药颗粒。本发明的系统通过对基于主动式微混合器的重结晶单元生成的炸药悬浮液进行后续的喷雾干燥处理，实现微流控技术与喷雾干燥技术的结合，从而能够快速连续地制备粒径分布较窄、具有优良的物理化学和爆炸性能的微纳米炸药。