本发明公开了一种用于火炬系统的水封装置及其操作方法。水封装置设有水封罐(1)、溢流液收集罐(2)、撇油和溢流管(8)、溢流液汇管(9)、U型溢流管(3)。撇油和溢流管竖直设置，顶部设有撇油和溢流漏斗(25)，底部与溢流液汇管相连。溢流液收集罐内设有撇油挡板(12)，撇油挡板将溢流液收集罐分隔为溢流液舱(14)和凝缩油舱(13)，U型溢流管的入口与溢流液舱连通。水封装置还设有凝缩油泵(4)、凝缩油泵进泵管道(18)、凝缩油泵输出管道(20)、凝缩油泵回流管道(19)、第一调节阀(27)和第二调节阀(28)。本发明公开了上述水封装置的操作方法。本发明主要用于石油化工企业的火炬系统。