一种可以自动精准定位的河道清淤船控制系统，包括船体、旋转结构、挖泥铲斗结构、第一定位结构、第二定位结构和第三定位结构；所述第一定位结构包括第一固定座结构和第一定位桩结构；所述第二定位结构和第三定位结构结构相同；所述船体上设有GPS定位仪和超声波探测仪。清淤船到达指定位置之后，第一定位结构中第一定位桩结构首先对船体进行位置确定，调整船体的位置角度之后，第二定位结构和第三定位结构中的第二定位桩结构进行最终定位，挖泥铲斗结构通过旋转结构的转动，在指定位置进行河底淤泥的挖起，然后放到船体的指定淤泥存放位置。各个结构协同合作，完成了清淤船的精准高效的清淤工作。