提供一种风电机组振动数据处理系统以及数据稀释方法，该风电机组振动数据处理系统包括：数据采集单元，用于采集风电机组的运行参数，所述运行参数包括振动加速度数据；远端服务器，从数据采集单元获取运行参数，基于振动加速度数据确定风电机组的转速，根据运行参数和转速形成风电机组的运行数据，针对每个统计周期，基于该统计周期内转速的波动情况确定多个数据稀释区间，分别从每个数据稀释区间提取第一预定数量的运行数据，以对所提取的运行数据进行存储。采用本发明示例性实施例的风电机组振动数据处理系统以及数据稀释方法，能够最大限度地提取有效数据工况信息，避免无工况导致的数据误删，保证了振动数据的全面性和有效性。