本发明实施例公开一种水质检测方法及系统，所述水质检测方法包括向自动采样端发送采样指令，根据自动采样端返回的响应信息向用户终端发布取样任务通知；其中，取样任务通知中携带有目标采样端的位置信息及取样时限信息；接收至少一用户终端根据所述取样任务通知的确认指令，获取用户终端的身份信息用于与目标采样端采集到的与当前取样任务通知对应的待检测水样本关联；在用户终端从目标采样端取样完成后，通知物流端将待检测水样本转运到检测端；或，根据检测端接收到待检测水样本的状态信息，确认待检测水样本转运到达检测端；通过检测端对待检测水样本进行检测，得到检测结果。水质检测平台可以根据临时多变的情况而完成水质检测。