本发明公开了一种疫情防控用医疗器械杀菌消毒设备,包括高温发生器和工作箱，所述高温发生器固定连接在工作箱内顶部，所述工作箱侧壁设有空腔，位于左侧所述空腔内侧壁滑动连接有第一滑动块，所述第一滑动块顶部固定连接有第一挤压杆，位于空腔内的所述第一挤压杆外侧壁套设有第一复位弹簧，所述第一滑动块通过第一连接机构连接有第一推动块。本发明通过工作箱、第一挤压杆、第二挤压杆、第一连接机构、第二连接机构、过滤板、电机和扇叶的相互配合工作下使得经过消毒液消毒或者高温消毒的医疗器械可以在扇叶的作用下加速已消毒医疗器械的干燥或冷却，提高了医疗器械杀菌消毒的工作效率，节约了时间成本。