本发明公开了一种高效抗菌防护口罩过滤层的制备方法，具体按照以下实施：首先利用静电纺丝技术结合固相分离法制备聚苯乙烯和多孔聚偏氟乙烯纳米纤维膜，然后采用界面化学反应法以及热固化处理在两纤维膜的接触界面处合成无机抗菌氧化物，从而得到外层疏水、界面抗菌、里层压电的高效抗菌防护口罩过滤层。疏水外层聚苯乙烯有效起到隔离外界水分，保护压电里层；以聚偏氟乙烯作为压电里层，提高静电吸附效率，多孔结构提高对病毒的吸附容量。两纤维膜的接触界面处利用化学反应法结合热固化处理合成无机抗菌剂，提高口罩过滤层的过滤效率。本发明可运用于提高口罩过滤层的过滤效果，也可运用在工业滤纸、防雾霾窗纱、抗病菌防水面料等方面，具有很好的应用价值。