本发明涉及过氧化氢技术领域，具体涉及一种制备过氧化氢的方法和系统。该方法包括：(1)在加氢催化剂存在下，将含有氢气和工作液的反应液进行氢化反应，并将得到的浆液进行固液分离，得到氢化液和循环浆液，并将所述循环浆液返回加入所述反应液；(2)将所述氢化液分为A液和B液；在再生催化剂存在下，将所述A液进行再生反应，得到再生氢化液；(3)将所述B液、再生氢化液和含氧气体进行氧化反应，得到氧化液；(4)将所述氧化液进行萃取，得到过氧化氢溶液和萃余液，并将所述萃余液返回加入所述反应液。该方法基本消除反应器床层温差，有效提高氢化反应选择性、装置效率以及氢化效率，延长加氢催化剂寿命；该系统简化装置、提高安全性。