本发明提供了一种基于电子换挡器的防盗方法及其系统，属于汽车技术领域。它解决了现有的该防偷盗系统防盗风险较低的问题。本基于电子换挡器的防盗方法包括以下步骤：车载控制器根据用户的身份钥匙来发出密码认证请求；电子换挡器在接收到密码认证请求时生成随机码，进而将随机码与其内部密码一进行结合形成密码认证信号一并发送给车载控制器，车载控制器对密码认证信号一进行处理并反馈密码认证信号二；电子换挡器对反馈的密码认证信号二进行密码比对校验，在校验结果满足解锁条件时，P挡驻车机构执行挡位解锁，实现挡位正常切换；反之，P挡驻车机构锁定挡位切换。还提出了一种基于电子换挡器的防盗系统。本发明能够降低车辆被盗的风险。