本发明实施例公开了一种信道干扰消除的方法、装置和系统；本发明实施例包括：接收用户设备上报的信道状态信息，微基站根据所述信道状态信息计算子频带干扰值，预设干扰阈值；所述微基站请求宏基站配置子帧，所述宏基站根据所述请求配置子帧；子频带干扰值大于干扰阈值，配置几乎空白子帧；子频带干扰值小于干扰阈值，分段配置子帧。该方案利用了一部分资源粒子可以用来传输用户数据，不用都配置成几乎空白子帧，造成整个子帧不能传输用户数据，频谱资源得到有效利用，提高了资源利用率，而空白化另一部分资源粒子，不传输任何数据，降低了微型小区所服务的用户设备受到的干扰。