本发明涉及激光技术领域，具体为一种百纳秒级激光脉冲波形畸变的抑制系统与方法，本发明将触发信号设置为方波对激光进行放大，观察放大后输出激光的脉冲波形，根据输出脉冲激光的锐化程度，利用任意波形发生器通过描点对输出波形进行预补偿；所述声光调制器同时与光源连接，在接收到任意波形发生器的描点触发信号后得到相应波形的脉冲激光，最终实现激光放大后的近平顶脉冲输出。本发明不仅解决了脉冲激光在放大过程中出现的脉冲波形前沿锐化问题，降低了脉冲激光的峰值功率，抑制了受激布里渊散射的光学非线性效应，同时也限制了激光脉冲宽度的窄化。