本发明公开了一种芳烃烷基转移的方法与系统，所述方法包括：1、将C9芳烃与甲苯混合得到混合原料一，再与氢气混合，得到混合原料二；2、混合原料二于烷基转移催化剂存在下进行反应，得到包含苯和C8芳烃的混合产物；3、步骤2得到的混合产物与步骤1得到的混合原料二换热，再依次进行冷却和气液分离处理；其中，在进行步骤2之前，采用预处理催化剂对C9芳烃和/或混合原料一和/或换热前的混合原料二和/或换热后的混合原料二进行预处理。本发明所述方法和系统可用于解决烷基转移反应器进料中多环芳烃、重质稠环芳烃、不饱和芳烃及其他杂质如水分、碳氧化合物等含量高的问题，起到保护烷基转移催化剂的作用，延长其使用寿命。