本发明提供一种基于人工智能的传染病在线问诊方法和系统，方法包括：疑似患者在传染病在线问诊APP填写个人信息及问卷调查信息，传染病在线问诊APP接收可穿戴设备传输的生理体征数据并进行存储；疑似患者的个人信息、问卷调查信息和生理体征数据通过互联网传送至医生端的电子病历系统，同时触发优先级提醒；将电子病历系统中的疑似患者信息通过智能诊断模块计算获得按概率大小排序的传染病候选列表，辅助医生进行诊治，医生安排相应的检查项目；对符合入舱条件的确诊患者，安排进入就诊舱进行隔离治疗，同时将确诊患者作为新病例添加到智能诊断模块的训练库中进行更新。本发明有效地完成疑似患者的早筛查、早发现和早诊断，减少疑似患者因心理紧张而大量赶往医院从而造成医院拥挤的现象，同时提高了医务人员进行后续诊治的效率。