本发明提供一种硅基负极材料及其制备方法和应用，所述制备方法包括如下步骤：(1)通过硅烷偶联剂对硅基颗粒进行改性，得到改性硅基颗粒；(2)将催化溶液和改性硅基颗粒混合，得到混合分散液；所述催化溶液包括质子酸和氧化剂的组合；(3)将混合分散液与导电单体的蒸汽进行聚合反应，得到所述硅基负极材料。所述制备方法将硅烷偶联剂改性和特定的导电单体聚合工艺进行结合，通过气液界面原位聚合反应在硅基颗粒的表面形成均一的导电聚合物包覆层，显著提升了硅基负极材料的分散性、均一性和循环性能，使其充分满足负极材料在高性能锂离子电池中的应用需求。