本发明提供了一种石墨加热器的自动包装系统，包括机架，第一输送机、第二输送机、第三输送机、机械手、包装袋输送单元、两组对称设置的撑口单元、抽真空单元以及两组对称设置的热封单元，利用包装袋输送单元自动上袋，撑口单元自动撑口，实现自动上袋撑口；机械手依次将内衬、石墨加热器以及外衬放入包装袋内，使内衬和外衬完全包裹石墨加热器，防止因外力的碰撞导致石墨加热器损坏，抽真空嘴穿过石墨加热器的电极孔插入内衬上开设的通孔内部，进行抽真空，使石墨加热器在抽真空的过程中，能够将空气完全排出，使包装袋能够完全贴合外衬的表面，使包装更美观，运输过程更稳定，降低了人员劳动强度，提高包装质量。