本发明公开了一种基于清洁能源接入后配电网运行维护低成本配置方法，包括确定清洁能源接入后孤岛运行产生的购电成本、环境效益及负荷转移因素；确定配电网运行维护产生的多种运维费用，计算配电网运行维护成本；构建配电网运维风险模型和配电网故障风险模型；构建配电网运维优化模型；基于配电网运维优化模型，并根据预设的约束条件，得到清洁能源接入后配电网运维优化配置结果。该方法通过对清洁能源接入后的购电成本、环境效益、运维成本以及运维及故障风险进行综合分析，构建了清洁能源接入下配电网运维优化模型，进而得到优化后的运维配置结果，根据得到的运维配置结果可以实现对配电网的低成本运维，且运维后配电网运行稳定性更高。