本发明公开了一种城市轨道交通自愈供电系统，该系统包括分布于轨道交通沿线的变电所、变电所间的连接电缆和对等通信网络以及自愈方法，变电所由对应的电气一次子系统和电气二次设备构成，电气一次子系统用于实现车站内的用电设备供电连接，并与电气二次设备配合实现不同运行工况的切换，不同工况包括：正常运行工况、检修工况和故障工况；电气二次设备通过通信网路获取所述供电系统的电气特征参数，依据参数变化自动判断所述供电系统运行状态，依据获取的系统失电原因并按照对应的自愈方法控制对应的电气一次子设备自动执行故障隔离或倒闸操作，从而实现多装置并行/协同工作，改善系统自愈性能，提高轨道交通服务水平。