公开了一种复杂岩性识别方法、识别系统、电子设备及存储介质。复杂岩性识别方法包括：构建二维卷积神经网络；利用测井曲线的每一个深度点的特征矩阵作为输入，以每一个深度点的岩性编码结果作为输出，训练网络参数，得到岩性自动识别网络模型；利用所述岩性自动识别网络模型，对测井数据进行岩性预测，获得多井复杂岩性识别结果。本发明通过提取测井曲线的多重信息，考虑到测井资料的纵向分辨率差异，建立深度窗内的测井信息矩阵作为特征矩阵，采用2维卷积神经网络建立岩性识别模型，该方法能较准确的识别复杂岩性储层的岩性，比其他方法如交会图、多分辨率图聚类、支持向量机、神经网络等精度更高。