发明提出了一种深层过滤介质/深层过滤系统及其在过滤水相待过滤液体中的应用，属于过滤技术领域。所述深层过滤介质的助滤剂包含微晶纤维素。所述深层过滤系统包括微晶纤维素助滤剂层和含或不含微晶纤维素助滤剂的深层过滤介质层。利用本发明公开的深层过滤介质或深层过滤系统可用于粘度较大样品的过滤，过滤效率高、相对活性回收率高，可替代或部分替代传统高速离心的方法或压滤法以实现水相待过滤液体固液分离，降低对生产设施设备的要求，降低生产成本，适于规模化生产和应用。