本发明公开了一种低温脉管制冷机，包括脉管组件、惯性管和压缩机，压缩机壳体内部连接有缸体，缸体的两侧的直线电机呈对称布置；直线电机包括活塞轴，活塞轴的端部连接有活塞头，活塞轴上连接有永磁体组；永磁体组由多个永磁体围合构成，相邻两个永磁体之间形成一个插槽，活塞轴穿设在磁极中，磁极包括磁环，磁环的内壁周向连接有多个径向杆，径向杆均插接在相应的插槽中，每个径向杆上均缠绕有导线圈；直线电机的活塞头均可滑移地连接在缸体内部的活塞腔内，活塞腔和脉管组件的输入端相连通，脉管组件的输出端通过惯性管和壳体内部相连通。本发明能够有效降低压缩机的振动和噪声，提升了机械转化效率，且具有体积小和制冷量大的特点。