本发明公开一种基于深度学习的MRI脊椎图像椎间盘扫描定位和椎骨标识方法，包括以下步骤：步骤s1：利用卷积神经网络模型对预先准备的MRI脊柱图像进行语义分割；步骤s2：在步骤s1语义分割所得到的图像上拟合前景像素得到多个多边形；步骤s3：进行多边形筛选；步骤s4：进行多边形排序并添加标签，完成椎骨标识；步骤s5：进行多边形边逼近，减少顶点数，使得多边形更接近四边形；步骤s6：计算并找出多边形的左下角顶点、左上角顶点、右上角顶点以及右下角顶点；步骤s7：计算椎间盘扫描定位线，完成椎间盘扫描定位。本发明可提高MRI脊柱检查的效率，减少人工工作量，并使得病人的多次检查的扫描位置具有很高的重复度。