本发明提供了一种燃气热泵供热系统，用于设置在供热管网中，对回水进行升温后输出供水，其特征在于，包括：并联设置的燃气热泵子系统和锅炉子系统，回水分为流入燃气热泵子系统的第一支路和流入锅炉子系统的第二支路，两个子系统单一运行或共同运行，其中，燃气热泵子系统包括至少一台燃气热泵机组，每台燃气热泵机组均包括燃气发动机、发动机余热换热单元、压缩机、冷凝器以及蒸发器，蒸发器中的制冷剂从空气或水源水中吸收热量，燃气发动机驱动压缩机压缩制冷剂，经压缩后的制冷剂在冷凝器中放热，发动机余热换热单元吸收燃气发动机余热放热，第一支路的水流经冷凝器以及发动机余热换热单元，进行热交换后吸收热量而升温。