本发明公开了一种异构远洋孤岛微电网系统及其分布式能源交易方法，属于远洋孤岛微电网能源管理领域，系统包括：发电岛、生产岛和负荷岛，方法包括：采用鲁棒优化方法处理可再生能源发电的不确定性问题，通过动态非合作博弈框架来实现发电岛、生产岛和负荷岛中聚合器之间的双向交互过程，并设计分布式迭代算法找到纳什均衡策略，即找到发电岛的最优供电量和最优电价，生产岛的最优购电量、最优供氢量和供水量、最优氢价和水价，以及负荷岛的最优购电量、购氢量和购水量、最优负荷能耗量，同时使得发电岛、生产岛和负荷岛中每个聚合器总成本最小。如此，本发明能有效解决远洋孤岛微电网多能源供应的问题，保证异构远洋孤岛微电网系统经济高效运行。