本发明提供一种高温超导电缆系统在线监控方法、计算机设备、存储介质，包括：根据三相超导电缆的三相电流判断所述高温超导电缆系统是否短路故障；根据三相超导电缆的零序电流判断所述高温超导电缆系统是否短路故障；根据与所述高温超导电缆系统互连的母线的三相电压判断所述高温超导电缆系统外部是否故障；根据三相超导电缆的液氮入口处的第一液氮温度信号以及三相超导电缆的液氮出口处的第二液氮温度信号判断所述高温超导电缆系统是否超负荷；若以上判断结果为是，则生成切除控制指令，将所述切除控制指令发送至保护装置以控制所述保护装置动作切除所述高温超导电缆系统。通过本发明，能够提高高温超导电缆系统的运行安全。