本发明公开了一种飞轮储能转子散热系统，主要由热管、翅片冷却结构、循环泵等构成。电动/发电一体机转子、电磁轴承转子和飞轮转子同轴固定，内部打孔，与旋转热管通过黏合、过盈配合、铜焊或锡焊连接。转子与真空壳体之间采用磁流体密封。本发明在热管蒸发段布置散热翅片，利用热管内工质从液态到气态的转变，将转子内部热量取出，采用循环泵排送氦气对热管蒸发段进行冷却，并通过冷却换热器冷却后循环。本发明具有换热效率高，散热量大的优点，可解决飞轮储能真空转子的散热问题。