本发明提供一种用于非正交传输的调制策略选择方法、系统、存储介质及终端，包括以下步骤：获取非正交传输系统中第一用户的信噪比γ₁和第二用户的信噪比γ₂，以及第一用户与第二用户的信噪比差距β＝γ₂/γ₁，其中γ₂＞γ₁；针对每种调制策略，设定第一用户的目标误比特率；基于目标误比特率计算第一用户的信噪比门限值在每种调制策略下比较信噪比门限值和信噪比γ₁，去除不满足的调制策略；计算信噪比差距门限值β^*；比较信噪比差距门限值β^*和信噪比差距β，去除不满足β≥β^*的调制策略；在剩余的调制策略中选择满足预设传输目标的调制策略。本发明的用于非正交传输的调制策略选择方法、系统、存储介质及终端有效提高了部分用户的吞吐量和系统频谱效率。