本发明涉及一种包覆药柱安全整形及检测智能加工系统，包括第一药柱箱定位装置、药柱箱转运机械手、第一空药柱箱定位装置、第一空药柱搬运机械手、上料传输机构、药柱整形检测装置、称重装置、激光散斑剪切干涉检测装置、壳体暂存托架、下料传输机构、阻燃隔离墙、第二空药柱箱定位装置、第二药柱箱定位装置和第二药柱搬运机械手；所述药柱整形检测装置共三套并排安装于上料传输机构和下料传输机构之间，便于药柱从上料传输机构转运至药柱整形检测装置的夹持单元内。本发明通过无人化、智能化的生产模式，提升产品生产效率和本质安全度，并对工艺过程进行精细化管控，进一步提高质量一致性并缩短包覆药柱整形制造周期。