本发明公开了一种高超声速风洞试验段内模型机构的隔振方法，包括以下四个环节步骤：a.将模型机构的支撑基础设置为独立基础平台，在独立基础平台与试验段基础之间设置隔振缝隙；b.将下机构的试验段下驻室安装在独立基础平台上，用矩形波纹管来消除与试验段主驻室连接的扩压器设备产生的振动；c.喷管与试验段之间采用充气密封结构的连接方式，杜绝振动经试验段传递到模型机构上；d.上机构采用两个门型桁架组成的板凳式结构进行支撑，实现上机构与试验段上驻室的振动隔离。本发明通过采用独立基础平台支撑，避免地面振动传递到模型机构上；通过采用充气密封结构，避免喷管等主体设备的振动传递到模型机构上，且隔振效果好。