本发明特别涉及一种基站兼容CPRI和eCPRI协议的方法。该基站兼容CPRI和eCPRI协议的方法，将PHY下行链路DL与上行链路UL处理流程的每一步用位图文件bitmap进行标识，并将位图文件bitmap中PHY下行链路DL与上行链路UL处理流程对应的bit位置位对应到需要执行的流程；RRU在程序初始化过程中读取配置文件中的位图文件bitmap，从而控制RRU运行节点；同时，RRU运行节点将位图文件bitmap各个bit位取反，通过协议数据包传送给BBU运行节点，从而控制BBU运行节点执行剩余的流程。该基站兼容CPRI和eCPRI协议的方法，通过程序读取配置文件的方式，不仅省去了代码重新编译、加载的步骤，提高了基站部署效率，还实现了基站BBU与RRU之间CPRI或者灵活PHY拆分的eCPRI中任意一种连接。