本发明公开了一种既有结构系统桩基承载力检测及耐久性评估方法，包括以下步骤：提供分布式安装于系统的多个激振装置和安装于系统内多点位置的多个位移响应采集传感器；多个所述激振装置同步地激发结构‑桩基系统产生竖向振动，由多个所述位移响应采集传感器采集结构系统中的多点位移响应；所采集的各点结构位移响应用于系统参数反演计算，由所反演的与桩基相关的系统参数计算桩基承载力和结构材料模量，并基于材料模量衰减规律评价结构耐久性。本发明方法可在结构系统正常运行条件下实现对桥梁、建筑等结构系统桩基承载力的无损检测和结构系统的耐久性评估。