本发明属于燃料电池领域，并具体公开了一种应用于氢氧燃料电池的零气体排放系统。该系统包括燃料电池堆、供气转置和缓冲装置，其中：燃料电池堆作为氢氧燃料电池的反应场所；供气装置包括氢气供气单元和氧气供气单元，用于为燃料电池堆提供氢气和氧气；缓冲装置的氢气缓冲单元中氢气缓冲罐一端与阳极气体出口连接，其另一端通过第一电磁阀与阳极气体入口连接；氧气缓冲单元中氧气缓冲罐一端与阴极气体出口连接，其另一端通过第二电磁阀与阴极气体入口连接。本发明利用静态缓冲容器包括氢气缓冲罐和氧气缓冲罐替代动态循环设备，并通过供气单元和缓冲单元的切换供气形成压差，将燃料电池堆中的水排出，能够有效提高燃料电池长时间稳定运行的能力。