本实用新型公开了一种医学用试管清洗设备，包括底座，所述底座内部的两侧皆设置有滑槽，所述底座的内侧设置有支撑箱，所述支撑箱的顶部和中间位置皆固定有支撑板，所述支撑箱的顶部均匀设置多组贯穿至支撑板底部的凹槽，所述凹槽的内侧设置有试管，所述支撑板的外侧皆均匀设置有多组第一通孔。本实用新型通过设置的软刷，双轴电机带动第一转轴转动，从而使第一转轴带动软刷对试管内壁进行旋转清洗，喷头喷水的水进入试管中，更好的配合试管的清洗，且通过设置的第一通孔，将碰头喷出的水进入到支撑箱内部，然后通过第二通孔流出，对废液进行及时处理，两组软刷同时工作，提高了工作效率，使清洗设备的使用效果更好。