本实用新型公开了一种湖泊藻类生态取样装置，包括装置主体、抽取机构、握柄、连杆、推杆、内槽、固定机构、限位机构、取样机构、提取筒、收集盒、推块、受压块、固定块、第二弹簧和通槽。本实用新型的有益效果是：将握柄进行拉动，握柄被拉动带动连杆移动，连杆移动带动推杆移动，由于第二弹簧一直处于拉伸状态，随着推杆的移动，令多个受压块在第二弹簧的带动下被内槽进行卡合，当受压块进入内槽的时候，带动推块在提取筒内部进行移动，则此时就能够将湖泊内的水抽取至提取筒内，同时提取相应的浮游藻类，继而通过通槽进入收集盒，由于装置主体上的不同高度设有多个提取筒，从而在使用时方便对不同深度的浮游藻类进行取样，使得得以提高取样的准确性。