本实用新型涉及一种养生蜂蜜多功能分层过滤系统，其包括设置在过滤筒中的过滤网，过滤筒远离底壁的一侧设有端盖，端盖上开设有进料口，过滤筒中转动连接有转轴，转轴在过滤网背离过滤筒底壁的一侧设有搅拌杆，端盖上设有输出端与转轴连接的电机；转轴远离电机的一端开设有进水槽，搅拌杆中开设有与进水槽连通的出水槽，搅拌杆靠近过滤网的一侧设有若干个喷头；转轴远离电机的一端设有与进水槽连通的旋转接头，旋转接头远离转轴的一端连接有高压水泵，高压水泵的进水端连接有储水箱。本实用新型通过对过滤网的冲刷去除掉过滤网上残余的蜂蜜，使得过滤网表面上的残渣分散，以减少残渣粘附在过滤网的表面造成过滤网堵塞的情况发生。