一种电机轴加工机构，包括台体，其中，所述台体上设有凹陷腔，所述凹陷腔设有水平设置的可转动的丝杆，所述丝杆上套有移动块，所述丝杆由电机驱动；所述移动块上设有打磨装置，所述打磨装置包括电机驱动转动的打磨杆，所述打磨杆的端部设有打磨座；所述打磨片设于打磨座上。本申请中的夹座用于从上下夹住电机轴，接着丝杆转动，带动移动块沿着丝杠移动，实现打磨装置的移动。打磨装置上的打磨片移动到电机轴的端孔中，进行打磨操作，使电机轴中心孔变得平整光滑，使产品精度高。底板和压板之间的距离可调，因此夹座可以夹住不同尺寸的电机轴。并且，通过转动拨盘，可以带动调节杆的伸缩，实现打磨片的位置调整，因此可以不同的电机轴内径。