本实用新型提供一种具有排水结构的燃料电池装置，包括封装壳体和设置在封装壳体内的燃料电池堆叠体；封装壳体顶部朝向燃料电池堆叠体的一侧包括由顶部中心至边缘向下倾斜的四个斜面，四个斜面构成四棱锥的四个侧面，顶部设置有气体出口；封装壳体侧壁底端设置有气体吹扫口；封装壳体底部边缘设置有排水渠，排水渠远离燃料电池堆叠体的一侧与排水管相连通；阴极流场包括间隔平行设置的第一流道和第二流道，第一流道两端分别设置有第一流道进口和出口，第二流道一端设置有第二流道进口另一端封闭。本实用新型通过封装壳体以及双极板的结构设置，避免由于催化剂水淹或质子传导速度下降导致能量转化效率降低，提高燃料电池的安全性和能量转化效率。