本实用新型公开了一种肠胃镜清理消毒装置，包括消毒桶和冲洗箱，消毒桶的下表面固定连接有电机箱，电机箱的内部设置有电机，电机的输出端设置有第一齿片，第一齿片的侧面啮合有第二齿片，第二齿片的上表面固定连接有转轴，消毒桶内侧壁的底端固定连接有隔板，转轴贯穿隔板的一端固定连接有旋转杆。该肠胃镜清理消毒装置，通过消毒桶、电机、第一齿片、第二齿片、转轴、旋转杆、清洗刷和过滤筐的设置，医护人员可以将肠胃镜放进消毒桶内，电机运转，第一齿片便会带动第二齿片转动，两个清洗刷相对转动，便可以搅拌消毒桶内的清洗液对肠胃镜进行充分的清洗和消毒，起到了很好的消毒效果，便于了医护人员的使用。