本实用新型公开了一种鱼类生物饵料分离装置，包括：工作台、两组支撑架、分离仓、驱动组件以及分离组件，两组支撑架匹配安装在工作台上表面两侧，所述分离仓套设在两组支撑架内部，且两组所述支撑架与分离仓接触位置通过轴承活动安装，所述驱动组件安装在工作台上表面，所述分离组件安装在分离仓内部，所述分离仓一侧安装有进料管，所述分离仓另一侧匹配安装有若干组出料管。本实用新型整体结构便捷，可稳定的对饵料进行分离筛分，使用效果佳，通过五组过滤板过滤精度逐步增大，且在离心仓的旋转配合下，可快速的将不同尺寸的饵料分离在不同的过滤腔内部，整体操作便捷，规避了传统分离装置在使用时极易发生堵塞的状况发生。