一种隧道式复合消毒方舱，包括复合消毒舱及蒸汽消毒舱，复合消毒舱的前端设有复合舱门，蒸汽消毒舱的尾端设有蒸汽舱门，两舱之间设有方舱互通门。复合消毒舱设有由风淋单元、紫外线单元、臭氧单元、电源单元及显示控制单元组成复合消毒杀菌机构。所述蒸汽消毒舱的顶部设有便于冷凝水导向的弧形舱顶，其顶部设有蒸汽发生机构，所述蒸汽发生机构由水箱、蒸汽发生器、储气箱、控制单元、蒸汽单元电源及出气管组成，出气管与设于蒸汽消毒舱两侧壁的蒸汽出口相接。本技术结构合理，兼有除尘及杀菌的作用，对多种病菌有较好的杀灭效果。