本实用新型公开了一种兽医专用粪便取样器，包括取样盒以及取样勺，所述取样盒包括带有取样内腔的取样筒以及密封盖，所述取样内腔顶端内侧的内螺纹部与密封盖底端的外螺纹部密封螺接，所述密封盖的顶端固定设有与取样筒顶部斗形套筒相插接的斗形密封柱，所述取样勺包括外套筒、与外套筒插接连接的导向柱、勺柄、固定设于勺柄上且与外套筒底端内侧的凹面限位卡槽卡接的限位凸起以及固定设于勺柄底端的勺子。本实用新型对于动物粪便取样方便，保存方便，而且能够避免粪便对环境的污染。