本实用新型提供一种细胞过滤装置，包括滤筛筒，所述滤筛筒密封安装在瓶体上，所述瓶体的上端设有抽气口，所述抽气口通过管道与抽气泵相连，所述滤筛筒包括筒体，所述筒体的顶端的四周设有边沿，所述边沿的顶端设有固定筒，所述固定筒上螺纹连接有空气过滤盖体，所述筒体的侧壁的中下端上设有若干滤孔，所述筒体底部设有挡板，所述挡板的中心处设有圆锥状或者圆台状的定位块，所述定位块上安装有内过滤筒，所述内滤筒的底壁和侧壁上设有若干滤孔。本实用新型能够对细胞液进行两次过滤，过滤效果较好，且该装置的过滤效率较高，且能防止在过滤过程中空气中的杂质等污染培养液。