本实用新型公开了一种分子生物学用电泳辅助装置，包括电泳槽和第一发热线，电泳槽底部两侧开设有卡槽，卡条底部固接放置槽，第一发热线设置于放置槽内部，放置槽内壁底部设置有第二发热线，电泳槽底部中部开设有凹形槽，电泳槽内部设置有凝胶槽，电泳槽顶部连接有槽盖。本实用新型分子生物学用电泳辅助装置第一发热线与第二发热线连通外部电源发热从而对电泳槽进行恒温加热，从而有利于稳定电泳试剂，有利于避免温差过大导致的带粒子迁移距离出错的情况产生，且放置槽一侧设有缺口，方便电泳槽固定于放置槽内部或从放置槽内部取下，方便后期对电泳槽进行清洗。