本实用新型公开了一种水体净化生态滤坝，包括：上游坝体，下游坝体，以及设于所述上游坝体及下游坝体之间的过滤区域；其中，所述过滤区域从左到右依次包括：砾石填充层，活性炭填充层，多孔填料球填充层；以及设于所述砾石填充层，所述活性炭填充层及所述多孔填料球填充层上方的植物层。本实用新型具有结构新颖独特，易建造，成本低，使用效果好，可有效改变生态滤坝基质填料放置的结构，随意取出来更换填料，方便使用；填料球悬浮于水体中，充分与河水接触，有利于生物膜生长更新，同时可持续降解水体中氮污染物，去除率高，滤坝过滤去除水体悬浮物，基质填料更换方便，不会产生阻塞现象、形成溢流坝，使用寿命长，可有效解决河流的生态环境保护，经济和社会效益巨大的有益效果。