本实用新型公开了一种医疗器械专用杀菌消毒装置，涉及医用设备技术领域，本实用新型包括箱体、清洗槽和消毒槽，清洗槽和消毒槽均设置于箱体内部，清洗槽设置于消毒槽上方，箱体一表面设置有注水口，清洗槽内部设置有搅拌杆，清洗槽一表面设置有上盖板，上盖板一表面设置有步进电机，且步进电机一端连接有驱动轴，搅拌杆与驱动轴连接，上盖板另一表面连接有雾化喷头，清洗槽与消毒槽之间连接有隔板，隔板一表面连接有紫外线灯，消毒槽内部设置有放置板，且放置板一表面设置有干燥槽。本实用新型一种医疗器械专用杀菌消毒装置，通过同时设置清洗槽和消毒槽两级处理结构，可根据医疗器械的实际使用情况对其进行清洗和消毒，有效提升使用适应性。