本实用新型提供了一种温差式加热处理系统，包括加热反应炉、搅拌杆、马达，搅拌杆的两端分别支撑在轴承上，加热反应炉的内壁层为加热层，外壁层为保温层，搅拌杆轴心内设有加热层。本实用新型所述温差式加热处理系统通过将加热反应炉加热到第一预置温度时，关闭热反应炉的加热层加热，并继续保持搅拌杆加热层的加热；将搅拌杆加热层加热到第二预置温度时，关闭搅拌杆加热层加热的方式，使得待处理物经过两段升温，这样不但可以杀灭病毒达到无害化的效果，而且待处理物不会被碳化，并且通过搅拌杆翻拌的关系不容易粘到搅拌杆上。