本实用新型公开了一种育秧水稻种子混合处理设备，包括混合箱和清理机构，所述混合箱顶部开设有进料斗，且进料斗下方设置有震荡过滤板，所述清理机构设置于震荡过滤板表面，所述震荡过滤板下方设置有转轴，所述螺旋桨边缘处包裹有柔性布，所述转轴一端连接有电机，所述混合箱底部开设有出料口。该育秧水稻种子混合处理设备种子通过表面呈网格状结构的震荡过滤板进行震荡过滤，该设置有利于对种子进行筛选，有利于提高种子的品质，同时可对种子中掺杂的杂质进行分离，有利于避免损坏到螺旋桨，且螺旋桨边缘处包裹有柔性布，该设置有利于防止螺旋桨的锋利边缘对种子发生切割，提高了种子混合时的安全性与存活率。