本实用新型公开了一种医用胃肠菌群采样接种设备，涉及采样接种技术领域，包括底座，所述底座内部的顶端中间处安装有液压推动器，所述液压推动器输出端通过螺栓连接有推动板，所述推动板的顶部四角处皆安装有缓冲机构，所述缓冲机构包括U型槽、缓冲弹簧、挡板与支撑杆，所述U型槽安装在推动板的顶部四角处。本实用新型通过设置了液压推动器、推动板与缓冲机构等结构，当需要升高采样接种箱时，开启液压推动器，使得液压推动器的输出端向上移动，使得推动板也向上移动，从而将采样接种箱升高到与操作人员身高相比配的高度，来配合操作人员工作，使得操作人员在这一高度工作，从而操作人员得到一种舒适的工作环境，将工作效率大大的提高。